冷凍干燥機系由制冷系統、真空系統、加熱系統、電器儀表控制系統所組成。主要部件為干燥箱、凝結器、冷凍機組、真空泵、加熱/冷卻裝置等。凍干機相對常規方法，凍干法具有如下優點：
許多熱敏性的物質不會發生變性或失活。醫學教育網收集整理。
在低溫下干燥時，物質中的一些揮發性成分損失很小。
在凍干過程中，微生物的生長和酶的作用無法進行，因此能保持原來的性狀。
由于在凍結的狀態下進行干燥，因此體積幾乎不變，保持了原來的結構，不會發生濃縮現象。 干燥后的物質疏松多孔，呈海綿狀，加水后溶解迅速而*，幾乎立即恢復原來的性狀。
由于干燥在真空下進行，氧氣極少，因此一些易氧化的物質得到了保護。
干燥能排除95%～99%以上的水分，使干燥后產品能長期保存而不致變質。
因物料處于凍結狀態，溫度很低，所以供熱的熱源溫度要求不高，采用常溫或溫度不高 的加熱器即可滿足要求。如果冷凍室和干燥室分開時，干燥室不需絕熱，不會有很多的熱損失，故熱能的利用很經濟。
正所謂沒有的技術，真空冷凍干燥技術的主要缺點是成本高。由于它需要真空和低溫條件，所以真空冷凍干燥機要配置一套真空系統和低溫系統，因而投資費用和運轉費用都比較高。